北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
胃腸腫瘤中心三病區是以消化道腫瘤為主要病種，特別是對結直腸腫瘤的，科室長期以來，堅持以“病人為中心”，消化道腫瘤，特別是綜合方面積累了豐富的經驗。科室主任顧晉教授現任中華腫瘤學會全國副主任委員，中國協會大腸癌專業委員會副主任委員，并為美國外科學院外籍會員（FACS）。在結直腸癌的方面積累了豐富的經驗，科室堅持多學科聯合查房，每周進行包括腫瘤影像，腫瘤內科及放療科，病理科等多學科會診，堅持為病人帶來符合國際規范的綜合。對胃癌的綜合規范化也具有相當的經驗。科室現有主任醫師3名，副主任醫師3名，主治醫師3名，住院醫師2名，高年醫師均具有留學經歷，大多具有博士、碩士學位。科室承擔國家及省部級多項科研項目，每年在國際知名雜志上發表多篇專業論文。胃腸外二科注重瞄準國際消化外科發展前沿，與世界多個知名的結直腸外科中心建立聯系，包括美國，法國，英國等多個國家的知名專家均曾多次蒞臨我科進行學術交流，胃腸外二科近年來所取得的成績也得到國際同行的認可。
乳腺腫瘤內科是以進展期乳腺癌診治為主的專科臨床科室，現有主任醫師3名，副主任醫師1名，主治醫師5名，住院醫師2名，臨床護士20名，開放床位33張。科室以乳腺癌綜合為重點，包括化療、內分泌、靶向等，強調規范化基礎上的個體化，尤其對于復發轉移性乳腺癌的更有豐富的經驗和獨到的見解，診治水平在國內享有盛譽，是NCCN乳腺癌指南中國版內科部分執筆人之一，主持和參與多項國內外臨床試驗。乳腺腫瘤內科近5年主持或參與完成了多項國家自然科學基金、國家973項目分課題、北京市新世紀百千萬人才工程、首都醫學發展科研基金、教育部高等學校博士學科點專項科研基金、北京市衛生系統高層次人才培養計劃、國家“十二五”重大專項課題。發表文章百余篇，其中SCI文章三十余篇。
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