北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
胃腸腫瘤中心三病區是以消化道腫瘤為主要病種，特別是對結直腸腫瘤的，科室長期以來，堅持以“病人為中心”，消化道腫瘤，特別是綜合方面積累了豐富的經驗。科室主任顧晉教授現任中華腫瘤學會全國副主任委員，中國協會大腸癌專業委員會副主任委員，并為美國外科學院外籍會員（FACS）。在結直腸癌的方面積累了豐富的經驗，科室堅持多學科聯合查房，每周進行包括腫瘤影像，腫瘤內科及放療科，病理科等多學科會診，堅持為病人帶來符合國際規范的綜合。對胃癌的綜合規范化也具有相當的經驗。科室現有主任醫師3名，副主任醫師3名，主治醫師3名，住院醫師2名，高年醫師均具有留學經歷，大多具有博士、碩士學位。科室承擔國家及省部級多項科研項目，每年在國際知名雜志上發表多篇專業論文。胃腸外二科注重瞄準國際消化外科發展前沿，與世界多個知名的結直腸外科中心建立聯系，包括美國，法國，英國等多個國家的知名專家均曾多次蒞臨我科進行學術交流，胃腸外二科近年來所取得的成績也得到國際同行的認可。
北京大學腫瘤醫院肝膽胰外一科創建于1996年。現有病床33張，醫師10人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱1人，中級職稱4人，在讀研究生4人，所有醫生均為研究生畢業。建科以來，在黃信孚及邢寶才主任的領導下，科室全體醫師秉承以"延長病人生存，改善病人生活質量，為病人解除病痛"為目標，把肝膽胰腫瘤綜合的理念與肝膽胰外科手術的近技術相結合，不斷創新，不斷提高，不斷完善，形成了鮮明的本科室的診療特色。在醫療、科研和教學方面居國內水平。同時，培養出了一大批研究生和青年醫師。
現任主任邢寶才，教授，主任醫師。擔任：中國協會肝癌專業委員會常委，中華外科學會肝臟外科學組委員，中華腫瘤學會肝癌學組委員，中國協會大腸癌肝轉移學組委員，中國協會膽道腫瘤委員會常委，中國協會胰腺癌委員會委員，衛生部腫瘤規范化專家委員會委員，北京協會理事，北京協會肝膽胰腫瘤委員會主任委員，北京腫瘤學會委員，北京大學肝癌中心副主任，北方肝癌專家委員會副主任。同時擔任多種雜志的編委和審稿專家。
北京大學腫瘤醫院胸部腫瘤內一科（原胸部腫瘤內科）是以肺癌診治為主、具有深厚沉淀、傳承并不斷發展的研究型臨床專科，多年來一直致力于中晚期肺癌規范化、個體化內科和多學科綜合及相關轉化研究。現有病床36張，醫護人員30名。10名醫生中高級職稱醫師6名，中級職稱醫師3名，初級職稱醫師1名，幾乎所有醫生均具有碩士或博士研究生學歷，3人具有國內外博士后研究經歷。護士隊伍中，主管護師4名，護師8名，本科及以上學歷8名。共同組成一支高素質、高學歷、具有豐富臨床和研究經驗、充滿蓬勃朝氣和積極進取的醫護團隊，醫教研綜合實力達國內水平。
