北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
消化腫瘤內科專注于胃腸道腫瘤的，以臨床研究推進臨床實踐，以人才培養帶動學科發展。專長于胃癌、結直腸癌、食管癌、胰腺癌、胃腸間質瘤、神經內分泌腫瘤、膽道腫瘤、肝癌等，以及難治性消化系統腫瘤的診斷與、綜合及個體化。消化腫瘤內科擁有60多張病床，2013年接診3萬余人次。患者來自全國各地以及海外。科室專業技術實力雄厚，特別在胃癌、食管癌等中國高發腫瘤以及結直腸癌的，我們積累了豐富的經驗，水平居于國內地位，病人在這里能享受到的醫療服務、的策略與方案。我們還為國內各大腫瘤專科醫院培養了數百人的研究生及進修醫生，推動了國內消化道腫瘤的規范化。同時我們基于臨床問題開展的臨床研究，以及牽頭承擔的數十項國家、省市級科研項目，提升了國內整個臨床水平，促進了學科發展。
北京大學腫瘤醫院介入科創建于1996年，是一個獨立的、有鮮明特色的臨床科室。目前介入病房有34張床位，醫師13人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱5人，中級職稱4人，住院醫師3人，在讀研究生4人。科室配備了GE大平板血管造影系統(4100IQ)，具有大視野DSA功能、三維血管成像和CBCT成像功能，三維血管容積成像使經血管的腫瘤介入準確性和性明顯提高，同時完成的CT斷層重建使經皮穿刺介入功能進一步完善。目前正在安裝配置國際Siemens Miyabi Angio-CT系統，該系統具有滑動64層螺旋CT功能和大平板數字化減影功能，并實現CT和DSA的真正融合，是現代影像學引導介入的典范，推動該科的介入達到國際先進水平。
我院手術室是為患者提供手術的外科臨床平臺科室，是北京大學腫瘤醫院打造國際化腫瘤專科醫院的重要戰略支撐。現有24個手術間，每年開展2萬余臺各類惡性腫瘤手術，包括胃癌、肺癌、乳腺癌、結直腸癌、食管癌、肝癌、腹膜后腫瘤、卵巢癌、胰腺癌、宮頸癌、前列腺癌、膀胱癌、腎癌、骨與軟組織腫瘤、頭頸腫瘤等各種常見及罕見的惡性腫瘤。依托于手術室先進設備及手術室護理團隊多年經驗，手術室護理團隊可熟練配合各項腫瘤常規及復雜手術。團隊在2D、3D、熒光腔鏡、超聲刀、Ligasure、ERBE等操作上具有豐富的臨床經驗;在術中超聲設備、自體血回輸設備、腹腔熱灌注化療設備、術中放療、胸科磁導航設備、人工心肺機等配合使用上也富有經驗。
