胃腸腫瘤中心三病區是以消化道腫瘤為主要病種，特別是對結直腸腫瘤的，科室長期以來，堅持以“病人為中心”，消化道腫瘤，特別是綜合方面積累了豐富的經驗。科室主任顧晉教授現任中華腫瘤學會全國副主任委員，中國協會大腸癌專業委員會副主任委員，并為美國外科學院外籍會員（FACS）。在結直腸癌的方面積累了豐富的經驗，科室堅持多學科聯合查房，每周進行包括腫瘤影像，腫瘤內科及放療科，病理科等多學科會診，堅持為病人帶來符合國際規范的綜合。對胃癌的綜合規范化也具有相當的經驗。科室現有主任醫師3名，副主任醫師3名，主治醫師3名，住院醫師2名，高年醫師均具有留學經歷，大多具有博士、碩士學位。科室承擔國家及省部級多項科研項目，每年在國際知名雜志上發表多篇專業論文。胃腸外二科注重瞄準國際消化外科發展前沿，與世界多個知名的結直腸外科中心建立聯系，包括美國，法國，英國等多個國家的知名專家均曾多次蒞臨我科進行學術交流，胃腸外二科近年來所取得的成績也得到國際同行的認可。
乳腺癌預防中心提供乳腺腫瘤診斷及方面的醫療服務。本中心于1998年在北京市重點學科專項資助下組建。2004年結構調整，成為具備乳腺腫瘤診治功能的一級臨床科室，功能涵蓋乳腺癌篩查，乳腺病變的診斷，原發性乳腺癌、隨訪及康復指導，復發性乳腺癌，同時開展相關臨床與基礎研究。
2021年科室醫生總人數30人，正高職稱人數6人，副高職稱人數8人，中級職稱人數13人，初級師人數3人。按學歷劃分：博士21人，碩士4人，本科4人，專科1人。科室主任：歐陽濤，副主任：范照青、何英劍。護士長：于新穎、徐京燕、孫紅娟。
本中心由門診診室4間、住院床位64張、門診穿刺室、超聲影像診斷室等部分組成。
“依據循證醫學原則，結合研究成果，提供規范的、專業化的醫療服務，保障乳腺腫瘤的總體療效”是“中心”的任務，“提供高品質的醫療服務，做出有指導意義的研究成果”是“中心”團隊追求的目標。
北京大學腫瘤醫院胸部腫瘤內一科（原胸部腫瘤內科）是以肺癌診治為主、具有深厚沉淀、傳承并不斷發展的研究型臨床專科，多年來一直致力于中晚期肺癌規范化、個體化內科和多學科綜合及相關轉化研究。現有病床36張，醫護人員30名。10名醫生中高級職稱醫師6名，中級職稱醫師3名，初級職稱醫師1名，幾乎所有醫生均具有碩士或博士研究生學歷，3人具有國內外博士后研究經歷。護士隊伍中，主管護師4名，護師8名，本科及以上學歷8名。共同組成一支高素質、高學歷、具有豐富臨床和研究經驗、充滿蓬勃朝氣和積極進取的醫護團隊，醫教研綜合實力達國內水平。
我院手術室是為患者提供手術的外科臨床平臺科室，是北京大學腫瘤醫院打造國際化腫瘤專科醫院的重要戰略支撐。現有24個手術間，每年開展2萬余臺各類惡性腫瘤手術，包括胃癌、肺癌、乳腺癌、結直腸癌、食管癌、肝癌、腹膜后腫瘤、卵巢癌、胰腺癌、宮頸癌、前列腺癌、膀胱癌、腎癌、骨與軟組織腫瘤、頭頸腫瘤等各種常見及罕見的惡性腫瘤。依托于手術室先進設備及手術室護理團隊多年經驗，手術室護理團隊可熟練配合各項腫瘤常規及復雜手術。團隊在2D、3D、熒光腔鏡、超聲刀、Ligasure、ERBE等操作上具有豐富的臨床經驗;在術中超聲設備、自體血回輸設備、腹腔熱灌注化療設備、術中放療、胸科磁導航設備、人工心肺機等配合使用上也富有經驗。
