北大醫院前身為北京醫科專門學校附設診察所，后陸續更名為北京醫科大學校附屬醫院、北平大學醫學院附屬醫院等。1946年，醫院隨北平大學醫學院并入北京大學，由此得名“北大醫院”。1952年，全國高等學校院系調整，北京大學醫學院獨立建院，設立北京醫學院，后又更名為北京醫科大學，醫院隨之先后更名為北京醫學院附屬醫院、北京醫學院第 一醫院、北京醫科大學第 一醫院。2000年，北京大學與北京醫科大學再次合并，醫院隨之更名為“北京大學第 一醫院”。2008年，醫院成為中央保健基地醫院。
2022年度中國醫院聲譽排行榜中，1個學科位列全國第 一，5個學科排名前五、9個學科排名前十。在領軍人才建設方面，擁有中國工程院院士1人、國家自然科學基金創新群體1人、萬人計劃領軍人才/團隊6人、國家自然科學基金杰出青年基金獲得者10人、長江學者特聘/特崗教授5人、教育部創新團隊2人、科技部領軍人才/團隊6人，其他國 家級高層次人才13人、北京市高層次人才31人。
北大醫院堅持以患者需求為導向，持續優化醫療服務。設有39個臨床科室、12個醫技科室，共有71個病區，開放床位2259張。2023年度，門、急診量324萬人次，出院患者11.2萬人次，手術近4.6萬余例，平均住院日5.4天。開展疑難危重患者的MDT診療，設有MDT團隊53個，囊括腫瘤、心血管疾病、卒中、代謝疾病、重癥、罕見病等各領域，年會診疑難病歷超過2000人次。
目前，全球約有8.5億人因各種原因患慢性腎臟病，面對如此龐大的腎臟病患者數量，只有我們人人了解腎病，關注腎病，才能為自己和別人營造更好的生活，才能保障“全民腎臟健康”。
