北京301醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎22項，國家發明獎3項，軍隊科技進步一等獎21項。醫院承擔“973”、“863”等各類課題800多項，在中國國內、國際公開發表的論文總數和國內論文被引用次數連續4年居全國醫院之首。
令狐恩強從事消化病及消化內鏡研究、臨床、教學及保健工作，緊貼臨床一線進行技術與理論創新。他提出的疾病分類、分型，被多個學會采納寫入指南。他定名和完善的消化內鏡隧道技術，打破了傳統內科和外科的界限，將一些原本由外科手術治 療的疾病轉為內窺鏡下，且創傷極小、術后恢復快、費用低、療效顯著；他在消化管道深部臟器損傷治 療方面處于世界領 先水平。
與外科手術比較，消化內鏡技術便是一種超級微創醫療技術。隨著臨床醫學與迅速發展的光機電信息科學、材料科學以及生物工程科學等領域高新技術的有機結合，有越來越多的手術在內鏡下完成，進而成為消化道疾病的常規方法。
目前我國癌癥發病率前五名里，與消化道相關的腫瘤占四個，分別是胃癌、結直腸癌、肝癌和食管癌。我國消化道腫瘤不僅發病率高，且病死率亦高居不下，所以開展消化道腫瘤的篩查與治 療刻不容緩。
