北京同仁醫院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫院是全國防盲技術指導組和防聾治聾技術指導組組長單位，設有世界衛生組織防盲合作中心和世界衛生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協會會員單位，設有北京同仁眼庫。
視網膜疾病：包括視網膜脫離、視網膜病變等。視網膜脫離是視網膜與其營養層分離的病癥，可能導致視力喪失。視網膜病變則包括糖尿病視網膜病變、高血壓視網膜病變等，這些都可能影響視力。
黃斑病變：如年齡相關性黃斑變性、黃斑裂孔等。年齡相關性黃斑變性是老年人常見的眼病，嚴重時可能導致中心視力喪失。黃斑裂孔則可能導致視力下降，甚至失明。
北京同仁醫院眼底科是我國培養眼底病專科高級醫療技術人員的主要基地之一。已經形成了一支年齡與知識結構合理、學歷層次高、兼顧臨床和臨床相關基礎研究、技術力量雄厚的眼底病學術梯隊，形成了新老結合、穩健而富有生氣的團結協作的集體，同時也成為一支具有凝聚力和較強攻關能力的團隊。本專科在職60人，目前擁有17名在職正高級職稱醫師和20名副高級職稱醫師，其中有6名為教授/博士生導師，7名為副教授/碩士生導師。擁有眼內腫瘤診治研究北京市重點實驗室；醫學人工智能研究與驗證工信部重點實驗室。
