北京同仁醫(yī)院以醫(yī)院綜合醫(yī)療為主體，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所為附屬科研機構，形成 “一院三所”發(fā)展格局，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為國家臨床重點專科，中醫(yī)眼科學為中醫(yī)重點學科。
北京同仁醫(yī)院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫(yī)院是全國防盲技術指導組和防聾治聾技術指導組組長單位，設有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協(xié)會會員單位，設有北京同仁眼庫。
北京同仁醫(yī)院擁有中國工程院院士1名，國家萬人計劃4人，長江學者1名，百千萬工程人選9人，國家杰出青年基金獲得者2名，國家青年基金獲得者1名，享受政府特殊津貼專家11名，榮獲省部級突出貢獻專家15人，北京學者4名，青年北京學者2名，萬人計劃教學名師1人。
眼底外科主要針對眼底疾病進行診療，包括但不限于視網膜疾病、黃斑病變、青光眼等。這些疾病在眼底外科中都有專門的診療方法，包括治 療、激光治 療、手術治 療等。如視網膜脫離通常需要進行手術治 療，而黃斑病變可能需要或者激光治 療，青光眼則可能需要、激光或者手術治 療。眼底外科是關注眼底疾病的專科，對于這些疾病的診治都有專門的方法和手段。
