北京同仁醫院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫院是全國防盲技術指導組和防聾治聾技術指導組組長單位，設有世界衛生組織防盲合作中心和世界衛生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協會會員單位，設有北京同仁眼庫。
北京同仁醫院擁有中國工程院院士1名，國家萬人計劃4人，長江學者1名，百千萬工程人選9人，國家杰出青年基金獲得者2名，國家青年基金獲得者1名，享受政府特殊津貼專家11名，榮獲省部級突出貢獻專家15人，北京學者4名，青年北京學者2名，萬人計劃教學名師1人。
同仁醫院歷經百余年發展，幾代同仁人秉承“精誠勤和”的院訓，弘揚醫院深刻的文化精髓。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發揚百年同仁優良傳統，苦練內功，精于內涵，不忘初心，創新發展，努力為人民群眾提供優質的醫療服務，為把醫院建設成為國內一 流、國際知 名的學院型醫院而奮斗。
在臨床相關研究方面，北京同仁醫院眼底科開展了增生性玻璃體視網膜病變發病機制的研究，視網膜下人工假體植入技術及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質組學分析，黃斑營養不良的致病基因定位研究，年齡相關性黃斑變性發病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續不斷的獲得了多項及省部級課題經費的支持。發表了系列高質量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。
