醫院總用地面積5.53萬平方米，總建筑面積15.7萬平方米；預防研究區（門頭溝西山園區）總用地面積7.33萬平方米，總建筑面積目前為3.7萬平方米，未來將達到9.2萬平方米。醫院設有36個病房，26個手術室（其中包含5個復合技術手術室），17個導管室，1521張編制床位數，實際開放床位數1291張。在職員工3571人，中高級職稱專業技術人員1440人（數據截至2020年12月31日）。同時，配備有血管造影機、雙源CT、核磁共振、PET-CT等與世界接軌的醫療科研設備。
醫院設有冠心病中心、心律失常中心、急重癥中心、心力衰竭中心、肺血管病中心、高血壓中心、臨床藥理中心、血脂異常與心血管病診治中心、內分泌與心血管病診治中心、血栓性疾病診治中心、特需醫療中心、成人外科中心、血管外科中心、小兒外科中心、術后恢復中心、麻醉中心、體外循環中心、放射影像中心、超聲影像中心、核醫學影像中心、功能檢測中心、臨床檢驗中心等臨床和醫技科室。
豐厚的科研基礎條件與科研平臺
阜外醫院擁有心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫學研究中心2個研究平臺，國家衛生健康委心血管臨床研究重點實驗室、國家衛生健康委心血管疾病再生醫學重點實驗室、心血管植入材料臨床前研究評價北京市重點實驗室、心血管疾病分子診斷北京市重點實驗室4個省部級研究平臺，以及中國醫學科學院冠心病風險預測與研究重點實驗室、中國醫學科學院肺血管醫學重點實驗室、中國醫學科學院心血管流行病學重點實驗室等7個醫科院級研究平臺。
“三高共管”試點建設項目自2020年12月啟動，先后在天津、河北、遼寧、河南等14個地區開展試點工作。截至2023年，該項目已在12省市啟動14個試點，管理近2萬例 “三高”患者。“三高共管”項目的試點地區平均血壓規范測量率達46%、血壓控制率達58%。
