在科研方面，近年來，在原發性閉角型青光眼和原發性開角型青光眼發病機制和早期診斷方面做出重大成績，其科研成果連續獲得2013年和2014年國家科技進步二等獎兩項，2012年中華醫學獎一等獎一項，北京科技進步二等獎一項。同時多人多項目承擔國家和北京市重點科研項目。

北京同仁醫院眼外傷專科成立于1968年，是國內早成立的集臨床、科研、教學于一體的眼外傷專科。北京同仁眼外傷專科技術力量雄厚，學科梯隊合理，擁有包括多位經驗豐富、享有盛譽的專家和教授在內的近20名副主任醫師以上職稱的高級專業人才。每月專家門診量在1700人次以上，固定病床50余張，年手術量達5000人次以上。

近年來眼外傷專科在國內率先開展各種眼外傷、眼底病的診治新技術，包括顯微眼內窺鏡下的視網膜脫離復位、眼內異物取出以及眼內窺鏡睫狀突光凝難治性青光眼等，為眼外傷患者提供了新的途徑;包括23G、25G微創玻璃體視網膜手術，在“微創意識”引領下積極開展微創玻璃體視網膜手術，以小侵襲或損傷達到佳手術療效。另外開展虹膜瞳孔損傷修復、帶虹膜人工晶狀體植入、鞏膜層間人工晶狀體固定、人工角膜鏡下玻璃體手術聯合角膜移植、各類兒童玻璃體視網膜病變的微創玻璃體手術、兒童復雜眼外傷的微創玻璃體手術、抗VEGF外傷性新生血管疾病等。

北京同仁醫院眼科屈光手術中心在原衛生部的批準和支持下，于1993年率先在國內開展了近視眼、遠視眼、散光及弱視的成因及角膜屈光矯治手術。時至今日，已成為國內每年完成屈光矯正類手術門診和手術總量多的屈光專科，是國內，具有國際影響力的屈光手術診療中心之一。

中心擁有一支實力雄厚的專業技術團隊，現有醫生8人，醫技9人，驗光師2人，護士1人。具有博士學歷人員5人、碩士學歷人員7人、本科學歷人員8人。其中教授和主任醫師3人，副教授和副主任醫師4人，主治醫師1人，副主任技師1人，主管技師9人。博士生導師1人，已培養博士研究生、碩士研究生100余人，進修醫生百余名。

為了大限度滿足患者門診、手術的需求，中心實行全年無限號門診，2017年門診量達6萬多人次，年手術量近1.5萬例。技術團隊多年來積累了大量的臨床手術及并發癥處理方面的經驗。