北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
北京大學腫瘤醫院肝膽胰外一科創建于1996年。現有病床33張，醫師10人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱1人，中級職稱4人，在讀研究生4人，所有醫生均為研究生畢業。建科以來，在黃信孚及邢寶才主任的領導下，科室全體醫師秉承以"延長病人生存，改善病人生活質量，為病人解除病痛"為目標，把肝膽胰腫瘤綜合的理念與肝膽胰外科手術的近技術相結合，不斷創新，不斷提高，不斷完善，形成了鮮明的本科室的診療特色。在醫療、科研和教學方面居國內水平。同時，培養出了一大批研究生和青年醫師。
現任主任邢寶才，教授，主任醫師。擔任：中國協會肝癌專業委員會常委，中華外科學會肝臟外科學組委員，中華腫瘤學會肝癌學組委員，中國協會大腸癌肝轉移學組委員，中國協會膽道腫瘤委員會常委，中國協會胰腺癌委員會委員，衛生部腫瘤規范化專家委員會委員，北京協會理事，北京協會肝膽胰腫瘤委員會主任委員，北京腫瘤學會委員，北京大學肝癌中心副主任，北方肝癌專家委員會副主任。同時擔任多種雜志的編委和審稿專家。
消化腫瘤內科專注于胃腸道腫瘤的，以臨床研究推進臨床實踐，以人才培養帶動學科發展。專長于胃癌、結直腸癌、食管癌、胰腺癌、胃腸間質瘤、神經內分泌腫瘤、膽道腫瘤、肝癌等，以及難治性消化系統腫瘤的診斷與、綜合及個體化。消化腫瘤內科擁有60多張病床，2013年接診3萬余人次。患者來自全國各地以及海外。科室專業技術實力雄厚，特別在胃癌、食管癌等中國高發腫瘤以及結直腸癌的，我們積累了豐富的經驗，水平居于國內地位，病人在這里能享受到的醫療服務、的策略與方案。我們還為國內各大腫瘤專科醫院培養了數百人的研究生及進修醫生，推動了國內消化道腫瘤的規范化。同時我們基于臨床問題開展的臨床研究，以及牽頭承擔的數十項國家、省市級科研項目，提升了國內整個臨床水平，促進了學科發展。
北京大學腫瘤醫院黑色素瘤與肉瘤內科，始建于2005年，通過十余年的快速發展，科室具有強大的醫療科研團隊，開設本院、南院共兩個病區，以及臨床轉化實驗室。年門診量30000余人次，收治患者8000余人次。全科在編醫生10名，研究人員2名, 合同醫生1名，在編均為博士學位,其中主任醫師4名，副主任醫師4名，研究員1名，副研究員1名。學科帶頭人郭軍主任，任Melanoma World Society (MWS) 副主席及中國臨床腫瘤學會(CSCO)副理事長兼秘書長等職務。科室多人數次獲得，市級人才培養計劃。近年留學回國青年醫師7人，與多家國際黑色素中心建立良好合作。
