北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
北京大學腫瘤醫院胸部腫瘤內一科（原胸部腫瘤內科）是以肺癌診治為主、具有深厚沉淀、傳承并不斷發展的研究型臨床專科，多年來一直致力于中晚期肺癌規范化、個體化內科和多學科綜合及相關轉化研究。現有病床36張，醫護人員30名。10名醫生中高級職稱醫師6名，中級職稱醫師3名，初級職稱醫師1名，幾乎所有醫生均具有碩士或博士研究生學歷，3人具有國內外博士后研究經歷。護士隊伍中，主管護師4名，護師8名，本科及以上學歷8名。共同組成一支高素質、高學歷、具有豐富臨床和研究經驗、充滿蓬勃朝氣和積極進取的醫護團隊，醫教研綜合實力達國內水平。
消化腫瘤內科專注于胃腸道腫瘤的，以臨床研究推進臨床實踐，以人才培養帶動學科發展。專長于胃癌、結直腸癌、食管癌、胰腺癌、胃腸間質瘤、神經內分泌腫瘤、膽道腫瘤、肝癌等，以及難治性消化系統腫瘤的診斷與、綜合及個體化。消化腫瘤內科擁有60多張病床，2013年接診3萬余人次。患者來自全國各地以及海外。科室專業技術實力雄厚，特別在胃癌、食管癌等中國高發腫瘤以及結直腸癌的，我們積累了豐富的經驗，水平居于國內地位，病人在這里能享受到的醫療服務、的策略與方案。我們還為國內各大腫瘤專科醫院培養了數百人的研究生及進修醫生，推動了國內消化道腫瘤的規范化。同時我們基于臨床問題開展的臨床研究，以及牽頭承擔的數十項國家、省市級科研項目，提升了國內整個臨床水平，促進了學科發展。
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