北京同仁醫院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫院是全國防盲技術指導組和防聾治聾技術指導組組長單位，設有世界衛生組織防盲合作中心和世界衛生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協會會員單位，設有北京同仁眼庫。
在臨床相關研究方面，北京同仁醫院眼底科開展了增生性玻璃體視網膜病變發病機制的研究，視網膜下人工假體植入技術及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質組學分析，黃斑營養不良的致病基因定位研究，年齡相關性黃斑變性發病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續不斷的獲得了多項及省部級課題經費的支持。發表了系列高質量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。
教學方面：培養了多名碩士研究生并指導了上百名住院醫，進修醫，主治醫及副主任醫師的臨床工作。科研成果: 以第 一作者和通訊作者的身份在核心期刊上發表論文30多篇，其中SCI文章4篇。參編論著6部。申請了北京市及科委的基金2項，已順利結題。實用新型專利2項。
眼底外科主要針對眼底疾病進行診療，包括但不限于視網膜疾病、黃斑病變、青光眼等。這些疾病在眼底外科中都有專門的診療方法，包括治 療、激光治 療、手術治 療等。如視網膜脫離通常需要進行手術治 療，而黃斑病變可能需要或者激光治 療，青光眼則可能需要、激光或者手術治 療。眼底外科是關注眼底疾病的專科，對于這些疾病的診治都有專門的方法和手段。
