目前，北京協和醫院共有4個院區、總建筑面積62萬余平方米，在編職工4300余人、兩院院士3人、臨床醫技及平臺科室59個、國家臨床重點專科29個、科研平臺6個、國家“雙”建設學科5個、國家重點學科12個、一級學科博士學位授權點9個、繼續醫學教育基地6個、國家住院醫師規范化培訓專業基地21個、國家專科醫師規范化培訓試點基地8個。開放住院床位2000余張，2023年手術量7.3萬例、年出院病人13萬人次。先后獲“全國文明單位”“全國衛生系統先進集體”“全國先進基層黨組織”“全國抗擊新冠肺炎先進集體”等稱號。同時，醫院還承擔著支援欠發達地區、國家重要活動醫療保障和突發事件主力醫療隊的重任。
曾學軍教授在多項首發基金連續十年支持下開展大型綜合醫院與社區醫療機構合作模式的研究。2005年始主持《社區中老年人健康管理規范》的制訂和推廣，成為國家公共衛生規范項目之一，并于2015年成為國家推薦標準。
北京協和醫院風濕免疫科從建科時僅有3張病床的小科室發展到今天，協和風濕免疫科已擁有68張病床，年收治患者1500例次以上，年門診量逾12萬人次，不僅注重系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕關節炎、強直性脊柱炎等常見風濕性疾病的規范診治，更強調對少見風濕性疾病、風濕性疾病重要臟器損害以及風濕性疾病嚴重并發癥的綜合診治，追求更精 確的診斷、更細致的評估、更有效的治 療效果。
2020年8月，北京協和醫院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統手工、批量操作、定性檢測的酶聯免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內三甲醫院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。
